Наброски сюжета, что будет развиваться и дополнятся по ходу игры.
3 года спустя оригинальной версии сюжета.
Шин-Ра становится все более сильной организацией, которая начинает вести весь мир. Руфус Шин-Ра оказался намного "сильнее" своего отца в плане управления организации. После событий с Эксперементами G, S, A прошло относительно мало времени. Однако элитный военный отряд SOLDIER стал только сильнее. Доктор Ходжо пытается до сих пор повторить эксперимент с Проектом S, но получается у него не совсем хорошо. Солджеры становятся сильнее и покорнее. Власть Шин-Ры теперь не ограничивается только ее работой и политическими силами. Теперь в ее руках и самая сильная военная организация мира.
Война с Вутаем давно закончилась, но жители острова продолжают бунтовать - диктатура компании приходится им не по душе.
Однажды волна радио соскакивает с обычной программы. Вместо нее жители всего мира слышат фразы, как будто зачитанные из Священных писаний:
Infinite in mystery is the gift of the goddess
We seek it thus, and take it to the sky
Ripples form on the water’s surface
The wandering soul knows no rest....
Профессор Ходжо, сидящий в своей лаборатории, вместе с намного более низким голосом, появившимся в радио, тихо произнес: "Loveless. Act One."
Шин-Ра всячески отрицает возвращение Сефирота на мировую арену. Однака Руфус прекрасно понимает, что ситуация безнадежная - единственные двое, кто могли знать повадки проекта S мертвы. Шин-Ра перерывает вверх дном оба материка и все острова - и в Вутае Турки находят Божественную материю. Вместе с отрядом Солджеров, что их сопровождал, Ценг и Верудо возвращаются в штаб. Однако там их ждет сюрприз - Последнее Притяжение нанесло свой первый удар. Рекруты повстанцев оккупировали нижние этажи, в то время как СОЛДАТы и оставшиеся Турки оказались на верхних этажах, воюя с четверкой очень опасных противников. Сефирот и Генезис вместе с Вайсом и Неро развалили бы корпорацию снова, если бы не Клауд и Тифа, что вовремя оказались в нужном месте. Когда Сефирот добрался до Руфуса, президент мог быть уже убит - но в игру вступают двое Солджеров первого класса - Энгиал Хьюи и Зак Фэйр, оживленные Клаудом с помощью Божественной Материи.
Атака была отбита, и теперь у людей не было сомнений в том, что вернулся Однокрылый Ангел.
Через несколько недель возвращена к жизни Айрис Генсборо. Винсент Валентайн, который в очередной раз попытался вернуть к полноценной жизни Лукрецию, снова получает отказ и уходит восвояси. Страйф пытается его остановить, но оборотень не слушает.
ЛАВИНА занимает нейтральную позицию.
Шин-Ра только ужесточает контроль и почти прямым текстом заявляет о том, что каждый, кто посмеет присоединится к повстанцам, будет расстрелян войсками. Вутай поддерживает, хоть и не открыто, Последнее Притяжение, не понимая, что это их не спасет, в случае если будет уничтожена Шин-Ра.
Последняя Фантазия действительно вступает в Первый Акт финальной пьесы.